При місцевому застосуванні в офтальмології закопують по 1-2 краплі 1% розчину (у дітей застосовують розчин меншої концентрації) у хворе око, кратність застосування – до 3 разів з інтервалом 5-6 год, залежно від показань.
При місцевому застосуванні в офтальмології розширює зіницю, ускладнює відтік внутрішньоочної рідини, підвищує внутрішньоочний тиск, викликає параліч акомодації. Зіниця, розширена, атропіном, практично не звужується при інстиляції холіноміметиків
Якщо призначено закопування розчину атропіну в одне око, можливо виникнення неприємних відчуттів унаслідок порушення бінокулярного зору. У деяких дітей виникає двоїння предметів, нудота і блювання, трапляються напади запаморочення.
Атропін в офтальмології у вигляді очних крапель використовується для розширення зіниці, він так само тимчасово паралізує акомодацію і повністю розслаблює апарат фокусування ока.