Від істинно багатоклітинних організмів колоніальні відрізняються насамперед нижчим рівнем цілісності (наприклад, на окремі подразники часто реагують окремі особини, а не вся колонія як ціле), а колоніальні протисти також нижчим рівнем диференціації клітин.
Відрізняються тим що одноклітинний організм складається з однієї клітини, багатоклітинний – з багатьох клітин, а колоніальний організм є колонією – групу слабо диференційованих клітин, не розділених на тканини.
У одноклітинних організмів всі функції організму виконує одна клітина, тобто немає диференціювання на тканини та органи; у багатоклітинних ж відбувається поділ на органи та тканини.
Колоніальні Колоніальні організми, водні організми, які при безстатевому (вегетативному) розмноженні залишаються з'єднаними з дочірнім і наступними поколіннями, утворюючи більш менш складне об'єднання — колонію.