Як і інші лікарські засоби, Есциталопрам може викликати побічні ефекти-«танець точок, піруетна тахікардія», хоч вони і не з'являються у кожного. Побічні ефекти зазвичай зникають за кілька тижнів після початку лікування.
У списку засобів, що поєднують ефективність із «м'якою» дією та мінімумом побічних явищ, лідирує агомелатин – препарат, що стимулює мелатонінові рецептори. Другим виявився СІЗЗС есциталопрам, який використовують не лише при депресії, а й при тривожних та панічних розладах.
Окремі антидепресанти можуть викликати нудоту, блювання, погіршення апетиту, біль у животі, порушення смаку, потемніння мови. Порушення роботи нервової системи: безсоння чи сонливість, запаморочення, тремтіння (тремор).
Антидепресанти можуть посилювати тривогу при тривожних розладах, а також викликати дратівливість і ажитацію – так називають безпричинне рухове збудження, неможливість всидіти на місці. Це не є небезпечним, але досить неприємним.