Вживання тютюну сприяє зниженню моторної функції шлунка та кишечника, негативно впливає на стан та функціональну активність печінки. Смертність від хвороб органів травлення – виразки шлунка і дванадцятипалої кишки – у людей, що палять, в 3,5 рази вище, ніж у некурців.
Цигарки, самокрутки, трубки та сигари однаково шкідливі. Некурильні види тютюну теж небезпечні здоров'ю. Наприклад, у снюсі є ті ж нітрозаміни, які викликають рак. Тютюн шкідливий не через хімічну обробку, а сам по собі: наприклад, у рослині вже є нікотин, який викликає залежність.
Нікотин тютюнового диму має протизапальні властивості. Є дані, що нікотин, у зв'язку зі своєю дією на баланс медіаторів ацетилхоліну і дофаміну в ЦНС, знижує ймовірність хвороб Паркінсона та Альцгеймера, проте є й наукові роботи з діаметрально протилежними висновками.