Відомі ізотопи скандія з масовими числами від 39 до 61 (кількість протонів 21, нейтронів від 18 до 40) та 12 ядерних ізомерів. Природний скандій є моноізотопним елементом із єдиним стабільним ізотопом 45Sc.
Число протонів визначаємо за порядковим номером елемента. Значить, число нейтронів в ядрі можна знайти, якщо від відносної атомної маси відібрати порядковий номер.
атом скандія Sc I відноситься до елементів IV періоду, у яких відбувається заповнення 3d-оболонки. Його електронна структура містить 21 електрон на 7 оболонках, з яких 20 електронів заповнили повністю 6 оболонок та 1 електрон заповнює 3d-оболонку.