Щоб вафлі не відволожилися, відразу після готування розклади їх на паперову серветку і дай охолонути. Після склади чаркою, прокладай кожну вафлю з обох боків пергаментним папером. Не прибирай вафлі в целофановий пакет і тим більше не клади їх із здобними виробами: вафлі перестануть хрумтіти і стануть м'якими.
Віденські вафлі слід зберігати у закритій упаковці при кімнатній температурі та вологості повітря не більше 75% Термін зберігання вафель залежно від начинки варіюються від 21 до 6 місяців.
Готові вафлі потрібно згортати одразу, поки вони ще гарячі та м'які. Після застигання вони твердіють і стають хрусткими. Вафельні ріжки можна скласти в харчовий контейнер та зберігати у харчовому контейнері у холодильнику або при кімнатній температурі.