Для лікування застосовують Флуконазол (або його аналоги: Дифлюкан, Флюкостат) по 200-400 мг 1 раз на день. Тривалість прийому таблеток визначає лікар залежно від тяжкості та перебігу хвороби.
При простому та ерозивному баланопостите достатньо місцевої дезінфікуючої та протизапальної терапії (теплі ванни з перманганатом калію, мазі – 1% декамінова, "Лорінден – С", "Гіоксизон", "Дермозолон", 10% ксероформна, присипки – дерматолом, ксероформом).
При різному баланопостите лікування таблетками чи мазями буде різним. Буває за баланопостите мазь на лікування призначається разом із прийомом антибіотиків. Іноді призначаються кортикостероїди, іноді протизапальні засоби. У деяких випадках цинкова мазь баланопостит лікує краще решти коштів.