Коли ви вперше відвідаєте Sootopolis, усі двері будуть замкнені, крім Pokemon Center і Poke Mart. Підніміться сходами на західній стороні Соотополіса поки ви не знайдете Стівена і Воллеса. Відбудеться довга сцена, у якій ви отримаєте або костюм аква, або костюм магми.
Тобі потрібно вирішити погодну кризу Хоенна щоб спортзал був розблокований; що означає знайти лігво, в даному випадку, Kyogre (пірнути на Route 128, щоб досягти Seafloor Cavern), розібратися з командою Aqua там, а потім повернутися до Sootopolis і мати справу з Kyogre, який тепер перемістився в Печеру Походження, яка є в Соотополісі.
Перш ніж отримати доступ до Cave of Origin, вам потрібно провести події в Seafloor Cavern, яка знаходиться вздовж маршруту 128 (дайвінг); саме там ви побачите підводний човен, а не в місці для дайвінгу в Соотополісі. Після кризи там Стівен відправиться в Соотополіс, і ви зможете розібратися з подіями там.
У Pokémon Emerald Воллеса вперше зустрічають на Печера Походження, де він веде гравця до Небесної колони, щоб розбудити Рейквазу. Коли гравець досягне Небесної колони, Уоллес відкриє її замкнений вхід, що дозволить гравцеві увійти до вежі.