Міністерство оборони Нагірного Карабаху опублікувало списки з іменами 2808 загиблих солдат . Число вбитих серед мирних жителів, за даними карабахської влади, склало 50, поранено 163. Влада Азербайджану повідомили про загибель 2906 військовослужбовців, ще 8 вважаються зниклими безвісти.
Пізніше, 17 вересня Міністерство оборони Азербайджану заявило, що в ході операції померли ще 3 поранених під час зіткнень військовослужбовців Азербайджану. У результаті кількість загиблих ЗС Азербайджану склала 80 військовослужбовців.
У республіці було сформовано 77-ту, 223-ту, 271-ту, 402-ту та 416-ту національні азербайджанські дивізії. Згідно зі статистичним дослідженням «Росія та СРСР у війнах XX століття» безповоротні втрати етнічних азербайджанців в війні становили 58,4 тис. осіб, у німецькому полоні перебували 20850 азербайджанців.